מאז 1996 מקיים המוזאון תוכניות מפגשים של ילדים , בני נוער ומבוגרים יהודים וערבים. המפגשים הם חלק מחזונו של המוזיאון כארגון לשינוי חברתי אזורי.
המפגשים מתקיימים במתכונות שונות ומשתנות משנה לשנה.
בכל התוכניות המתקיימות במוזיאון המטרה העיקרית של התוכנית היא מפגש תרבותית והאמצעי משתנה מתוכנית לתוכנית.